吉木萨尔县位于新疆维吾尔自治区东北部，准噶尔盆地东南缘，地理坐标为东经88°30′-89°30′，北纬43°30′-45°30′。东邻奇台县，西与阜康市接壤，北越卡拉麦里岭和富蕴相连，南以博格达山分水岭同吐鲁番地区、乌鲁木齐市为界。县城吉木萨尔镇。全县总面积8169.86平方千米，总人口132577人（2003年）。有汉族、回、哈、维吾尔、蒙等13个民族。
邮编：831700 代码：652326 区号：0994 拼音：Jimusa'er Xian
地势南北高、中间低，地貌可分为南部山区、中部平原、北部沙漠三种类型。主要河流有二工河、西大龙口河、渭户沟河、白杨河等。属温带大陆性气候，冬季长而严寒，夏季短而炎热，春秋季节不明显，干旱少雨，昼夜温差大。
吉木萨尔县气候独特，四季分明，年平均气温6.5℃，年均降水量183毫米，水资源总量4.4亿立方米，现有耕地64.14万亩、各类草场888万亩、林地53.7万亩。南部山间盆地具有天山北坡独有的逆温带气候，年降雨量355mm左右，中部平原是绿洲农业区，独特的气候水土条件，丰富的生物资源，使吉木萨尔县成为各类农产品盛产区，其中尤以红花、番茄、大蒜等特色农产品享誉区内外。
吉木萨尔现境内矿产资源丰富，县境内已探明矿种30余种，尤以石油、煤炭、天然气、油页岩、沸石、膨润土等矿产资源可观，具有较强的资源开发优势。其中石油储量1.5亿吨，天然气300亿立方米，年产200万吨的彩南油田是国内第一个沙漠整装油田。煤炭资源优势极为突出，具有储量大、煤种全、煤质优的特点。根据新疆地矿局第九地质大队所作的《新疆吉木萨尔县南山一带煤炭资源调查地质报告》，我县南天山一带煤炭储量为11．6亿吨，北部五彩湾一带目前已探明储量200亿吨，预计煤炭总储量在1600亿吨左右，大部分为31号不粘结煤，俗称无烟煤，是理想的民用和化工用煤。其它矿产资源主要为油叶岩、石灰石、膨润土、叶蜡石、沸石、石英砂、花岗岩、天然沥青。主要分布在天山一带和准东五彩湾一带。目前均未详细勘探和规模化开发，矿产资源开发前景十分广阔。近年来，我县按照国家和自治区实施优势资源转换战略的要求，统筹资源配置，积极加大矿产资源的勘探和开发力度，以优势资源转换为突破口，拓宽招商引资渠道，引进国内有实力的资源勘探和开发企业，实施优势资源转化战略，推进地区经济发展，已经引进神华集团、神东天隆公司、湖北宜化、新疆国泰新水公司等国内有实力企业计划总计200亿元左右，重点发展煤电、煤化工产业基地，项目固工作已经开始启动。
吉木萨尔县虽无江南优美的风光，却有着众多的自然和人文景观：历史悠久的北庭故城、西大寺，浩渺的大漠风光，独一无二的古海温泉、野马中心，神奇的古生物化石硅化木，气候宜人的青松森林公园，贯穿天山通往吐鲁番的车师古道以及沿途的龙沟遗址、高山神泉、天堑石堡等险峻而优美的原始奇景是旅游观光者流连往返。南部天山是国家天然林保护区，马鹿、天山雪鸡、野山羊、牦牛等珍稀野生动物活动其间。
吉木萨尔县辖4个镇、5个乡：吉木萨尔镇、三台镇、泉子街镇、北庭镇、二工乡、庆阳湖乡、老台乡、大有乡、新地乡。境内有：农六师红旗农场、农六师一〇七团。
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