巴里坤哈萨克自治县位于天山东段北麓。东与伊吾县毗邻，西与木垒哈萨克自治县相连，南与哈密市相接，北与蒙古国交界（边境线长305公里）。东西长276.4公里，南北宽180.6公里，总面积3．84万平方公里。辖2镇、10乡，47个村民委员会。境内驻有新疆生产建设兵团哈密农场管理局2个农（牧）场。县城距乌鲁木齐市709公里。1995年末总人口为10
.08万人，其中哈萨克族占 28.43％，汉族占 69.78％，其他民族占 1.79％。
地势南高北低，西高东低，西部、南部为天山山脉，中部为北天山及丘陵山区，由西向东倾斜形成起伏不平的波浪式谷地，东部、北部为平原地区。水资源主要来自冰川融水和山间泉水。属温带大陆性干旱气候，气温变化剧烈，南北气候差异明显，降水量分布极不均匀，年均气温3.6℃，年均降水89毫米。
巴里坤哈萨克自治县辖4个镇、8个乡：巴里坤镇、博尔羌吉镇、大河镇、奎苏镇、萨尔乔克乡、海子沿乡、下涝坝乡、石人子乡、花园乡、三塘湖乡、大红柳峡乡、八墙子乡。境内有：兵团红山农场、兵团红星一牧场、红星一牧场良种繁育场。县人民政府驻巴里坤镇。
巴里坤镇
代码：652222100 辖7个社区：广东路社区、广场巷社区、新市路社区、团结路社区、解放路社区、光明路社区、天山路社区。
奎苏镇
代码：652222103 辖10个村委会：奎苏村、二十里村、拐把头村、三十户村、南湾村、小柳沟村、板房沟东粱村、板房沟村、楼房沟村、牧业村。
博尔羌吉镇
代码：652222101 辖2个社区： 镜儿泉社区、二红山社区。
大河镇
代码：652222102 辖8个村委会：旧户西村、大柴沟村、干渠村、东头渠村、旧户东村、新户村、商户村、西户村。
下涝坝乡
代码：652222202 辖2个村委会：下涝坝村、小红柳峡村。
萨尔乔克乡
代码：652222200 辖3个村委会：苏吉西村、苏吉东村、自流井村。
石人子乡
代码：652222205 辖4个村委会：三十里馆子村、石仁子村、大泉湾村、韩家庄村。
海子沿乡
代码：652222201 辖3个村委会：海子沿村、尖山子村、卡子湖村。
花园乡
代码：652222206 辖3个村委会：花庄子村、南园子村、头道河村。
三塘湖乡
代码：652222207 辖4个村委会：中湖村、上湖村、下湖村、岔哈村。
八墙子乡
代码：652222209 辖1个村委会：阿格喜沃巴村。
大红柳峡乡
代码：652222208 辖3个村委会：大红柳峡村、花儿刺村、北山村。
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